脸红不宜喝酒、中国人群甲状腺疾病风险高 全自主中国人群基因研究成果发布

2020年05月13日 16:08  解放日报

 
 

  中国人群中先天性甲状腺功能减低症、慢性胰腺炎、遗传性掌跖角化症等疾病的致病基因变异携带者较欧美人群显著更多,具地域分布特征 

  北方人比南方人酒量相对更好,藏族、蒙古族、彝族人群和河南人酒量居于全国前列,但山东人酒量并不突出,福建人和广东人排在最后 

  4月30日,中国代谢解析计划(ChinaMAP)联盟携全国29家研究机构和医院,在中科院上海生命科学研究院主办的《细胞探索》杂志发表研究结果,首次报道ChinaMAP一期研究对覆盖全国27个省份和直辖市,8个民族,超过1万人的高深度全基因组测序数据和表型的系统性分析。上海交通大学医学院附属瑞金医院、国家代谢性疾病临床医学研究中心王卫庆教授和毕宇芳是论文的共同通讯作者,曹亚南、李林和徐敏研究员等为共同第一作者。此次发表意味着,通过中国人自己的仪器、平台、分析方法,对中国人的基因组特征进行研究,具有前所未有的本土意义。

  具有特有变异位点 

  王卫庆介绍,研究团队对队列中代表中国不同地区和民族的10588人的DNA样本,使用华大基因华大智造的国产自主高通量测序平台进行40×深度全基因组测序,完成了高质量的中国人群遗传变异数据构建、中国人群体结构分析、基因组特征比较以及变异频谱和致病性变异解析。在ChinaMAP一期数据库中,包含1.36亿个基因多态性位点SNP和1000万个插入或缺失位点(NDEL),其中一半是在国际通用的多个数据库中均没有的新位点。

  那么,中国人群是否具有特有的遗传性疾病相关变异位点?曹亚南介绍,中国人群中先天性甲状腺功能减低症、慢性胰腺炎、遗传性掌跖角化症等疾病的致病基因变异携带者较欧美人群显著更多,且具有地域分布特征,“如与甲状腺功能减退发生相关的一些致病变异频率在中国人群中比欧美人群高10倍以上。”在营养代谢和药物代谢相关遗传特征上,ChinaMAP一期研究对受到大众广泛关注的酒精代谢能力也做了研究——总体而言,北方人比南方人酒量相对更好,藏族、蒙古族、彝族人群和河南人酒量居于全国前列,但山东人酒量并不突出,福建人和广东人排在最后。研究证实,导致喝酒脸红和酒精代谢能力差的乙醛脱氢酶2基因rs671变异是东亚人特异性的,在中国人群中的携带者远高于全球其他人群,“rs671变异也是诱发食管癌发生的重要风险因素,喝酒脸红还是应少喝酒。”

  建高质量中国人群数据库 

  研究团队也对抗凝药华法林的减量使用、抗血小板药物氯吡格雷的适用人群分类、他汀类降脂药副作用风险人群进行分析。“如高脂血症患者常用的降脂药辛伐他汀,中国人中有超过20%的个体存在横纹肌溶解这一不良反应的风险。”

  而对于代谢性疾病,特别是2型糖尿病和肥胖,在全球的精准评估治疗中也因基因变异和遗传因素非常不同。“如欧洲人群中最显著的2型糖尿病遗传风险TCF7L2基因变异(如rs7903146)在中国人中的频率很低,并不重要,在代谢特征和疾病研究中仅参考和验证欧美人群的结果是不行的。”此次研究者以量化评分、年龄和血糖值的排序三维显示了每个人在整个群体中的精确位置,多基因风险评分排名显示2型糖尿病高风险和低风险的个体间存在非常显著的血糖差异,高风险个体随着年龄增加,空腹和餐后2小时血糖都显著高于中风险和低风险者。

  此次研究以覆盖中国各地区的研究队列为基础,建立了高质量中国人群数据库,未来可为疾病机制研究、预防、遗传咨询和公共卫生管理提供依据。据悉,今年2月下旬,ChinaMAP报道的新冠病毒受体ACE2相关变异在全球不同人群中的比较分析成果在《细胞发现》发表,已被访问下载超过20万次。ChinaMAP对汉族和少数民族群体的精确遗传结构分析,也为中国人群的精准基因组学研究提供了参考数据。

 
 

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